Ancien directeur général de Thales Microsonics et actuel Pdg de Temex, Jean-Yves Courtois a commencé sa carrière dans la recherche fondamentale à sa sortie de Polytechnique en 1989. Il a réalisé une thèse et une habilitation à diriger des recherches dans le domaine de la physique quantique et a travaillé avec Claude Cohen-Tannoudji, le dernier Prix Nobel français. Il a ensuite effectué des missions technologiques comme adjoint du conseiller scientifique du Délégué Général pour l'Armement. Il a été également enseignant à Paris VI et Paris XI ainsi que professeur à l'école Polytechnique où il a enseigné la physique.

Cette première vie scientifique s'achève en 1997. Jean-Yves Courtois décide alors d'entrer dans l'industrie à Thomson-CSF qui allait devenir Thales. Après 18 mois passés à la direction technique de Thomson-CSF Optronique, il rejoint une branche pour composants du groupe, où il s'occupe de stratégie et de business development. Il travaille notamment sur le dossier de création d'une nouvelle activité de modules pour radiotéléphones à partir des unités composants dont faisait partie le site de Sophia Antipolis. Aussi, quand cette activité commence à décliner, c'est lui qui est chargé de la réorganiser.

Il est ainsi arrivé dans la technopole en avril 2001 tandis qu'en parallèle il créait un joint venture avec Taïwan sur les modules. L'activité de Sophia diminuant fortement durant l'année 2001 (- 40%), il a été appelé à prendre la direction de Thales Microsonics à partir de septembre 2001 avec pour mission de la restructurer puis de la céder. Ce qu'il a fait avant de se voir attribuer la direction du nouveau groupe issu de la fusion entre Thales Microsonics et son repreneur Temex, et s'installer ainsi dans sa deuxième vie de chef d'entreprise.